人工智能学习:数据集的运行

发布于:2022-12-30 ⋅ 阅读:(569) ⋅ 点赞:(0)

目录

前言

一、软件准备

       1.安装PyCharm

       2.下载Anaconda3

       3.下载PyTorch并查检查显卡

二、运行步骤

      1.从github下载代码并在pycharm中打开

      2.建立一个虚拟环境

      3.数据集的运行

      4.结果展示 ​

总结


前言

在深度学习的人工智能和计算机视觉技术的快速发展下,医学影像分析领域得到了长足的发展。本文将以MedMNIST数据集为例做一个数据集的运行。


一、软件准备

1.安装PyCharm

这里建议直接安装破解版,免去不必要的麻烦,点击下列链接下载:

下载通道百度网盘丨64位下载链接:

https://pan.baidu.com/s/1RaZJicGGUhBFCEh1Jy12lw

提取码:a66w

2.下载Anaconda3

参考文章:http://t.csdn.cn/XSs0F

3.下载PyTorch并查检查显卡

参考文章:http://t.csdn.cn/Q82Z6

二、运行步骤

1.从github下载代码并在pycharm中打开

代码地址:https://github.com/MedMNIST/MedMNIST

打开后就是这个样子

 由于要用到Anaconda,所以我的setting设置成了这样:

2.建立一个虚拟环境

由于最新版本Anaconda3的默认环境base是python3.9,因此我重新创建了一个虚拟环境pytorch(不唯一,我的是pytorch),创建过程如下:

(1)进入 Anaconda prompt命令窗口

(2)输入以下命令创建环境:

conda create -n pytorch python=3.8

(3)创建成功后,输入以下命令,即可查看所有环境

conda info --envs

 (4)如果在Anaconda中有自己创建的环境pytorch,右键能打开终端,说明环境创建成功

(5)打开 Anaconda prompt命令窗口,输入下列命令就可以进入你刚刚所创建的环境

conda activate pytorch

3.数据集的运行

(1)首先需要安装一些东西,在pycharm终端输入以下内容

pip install medmnist

 安装完成后,输入以下内容可查看版本

>>> import medmnist
>>> print(medmnist.__version__)

 (2)依次在pycharm终端输入下列代码命令

查看需要下载的数据集:

python -m medmnist available

下载所有的数据集,注意可能会由于网络问题下载失败,一共有18个,可多次下载直到18个数据集(12个2D模型+6个3D模型)完整下载

python -m medmnist download

打印给定子集标志的数据集详细信息

python -m medmnist info --flag=xxxmnist

 将数据集保存为标准图形和csv文件,2D用第一个,3D用第二个

python -m medmnist save --flag=xxxmnist --folder=tmp/ --postfix=png
python -m medmnist save --flag=xxxmnist3d --folder=tmp/ --postfix=gif

需要注意的是,在pycharm和终端都可以运行命令,但是在终端更方便,运行后会自动生成tmp文件夹,里面存放了数据集训练结果和csv文件,可以通过查看路径找到tmp文件夹,路径查看方式如下:

pytorch中tmp路径

 pycharm中tmp路径

4.结果展示 


总结

至此,运行MedMNIST数据集的全部过程已记录完毕,在学习过程中,每一步都要细心,多留意路径问题。需要注意的是,要钻研一下代码,看不懂也没关系,要知道大概是干什么的,不然就会像我一样经常报错还不知道原因... ...不过遇到问题就要解决!!!在此将运行数据集的全部过程做一个简单记录,希望今后能有更大的成果。


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